PORTUGAL@FOLDING - uma forma de contribuir para construir um futuro melhor

Ascendemos ao 34º lugar mundial e é com certeza que, de entre 1 a 2 dias, iremos subir mais uma posição.

São destes pequenos feitos que a pouco e pouco vamos subindo na lista dos que mais ajudam para um projecto tão importante como este.

Por isso, optámos por uma estrutura algo diferente. Achamos que é essencial compreender o que é o projecto Folding@Home.

Entender aquilo que estamos a fazer, aquilo para o qual estamos a contribuir...

Esperamos então contribuir para que, aos poucos, todas as dúvidas sejam esclarecidas...

Doenças estudadas pelo Folding@Home (Parte 1)

INTRODUÇÃOO projecto Folding@Home ("FAH") é dedicado a entender o enrolamento das proteínas, as doenças que resultam do mau enrolamento e agregação das proteínas, e novas maneiras computacionais para desenvolver novas drogas no geral.

Aqui, descrevemos brevemente os nossos objectivos, o que estamos a fazer e alguns destaques.

Nós achamos que um projecto de computação distribuída não deve apenas correr cálculos em milhões de máquinas, mas sim produzir resultados, especialmente na forma de publicações, seminários e outras maneiras de espalhar os resultados do FAH para a grande comunidade científica.

O QUE É O ENROLAMENTO DE PROTEÍNAS E COMO É QUE ESTÁ RELACIONADO COM AS DOENÇAS?

As proteínas são colares de aminoácidos -- longas cadeias de moléculas.

As proteínas são a base de como a biologia faz as coisas.

As enzimas (proteínas) são o motor por detrás de todas as reacções bioquímicas que faz a biologia funcionar.

Como elementos estruturais (algumas proteínas), são os principais constituintes dos nossos ossos, músculos, cabelo, pele e vasos sanguíneos.

Os anticorpos (proteínas) reconhecem os elementos invasores e permitem ao sistema imunitário livrar-se desses mesmos invasores.

Por essas razões, os cientistas sequenciaram o genoma humano -- o esquema para todas as proteínas na biologia -- mas como é que podemos compreender o que fazem estas proteínas e como é que funcionam?

Todavia, apenas sabendo essa sequência diz-nos pouca coisa sobre o que a proteína faz e como o faz.

De modo a procederem à sua função (como por exemplo, enzimas ou anticorpos), elas têm de assumir uma forma particular, também conhecido com enrolamento' (fold).

Assim, as proteínas são máquinas fantásticas: antes de fazerem o seu trabalho, elas montam-se a si próprias.

Esta auto-montagem é denominada enrolamento (folding).O que acontece se as proteínas não se enrolam correctamente?

Acredita-se que doenças como Alzheimer, Huntington's, Fibrose Quística, BSE, uma forma hereditária de enfisema pulmonar, e muitos tipos de cancro resultam de um mau enrolamento proteico.

Quando as proteínas não enrolam correctamente, elas agregam-se.

Estes agregados podem regularmente juntar-se no cérebro, onde se acredita que causam os sintomas da doença das Vacas Loucas.


QUE DOENÇAS OU PROBLEMAS BIOMÉDICOS ESTÃO CORRENTEMENTE A ESTUDAR?


DOENÇA DE ALZHEIMER (DA)A doença de Alzheimer é causada pela agregação de relativamente pequenas (42 aminoácidos) proteínas, chamadas peptídeos Abeta.

Estas proteínas formam agregados que mesmo em pequenos grupos aparentam ser tóxicos aos neurónios e causam morte celular neuronal envolvida na Doença de Alzheimer e as horríveis consequências neurodegenerativas.

Temos vários cálculos a ser feitos na DA. Os nossos principais objectivos são a previsão da estrutura de agregados da DA para perspectivas de um projecto racional de drogas, assim como uma vista mais pormenorizada de como se formam cineticamente os agregados da DA (na esperança de cimentar o caminho para um método de impedir a formação de agregados da DA).

Têm havido muitos projectos, incluindo as séries 500 e séries 700. Até agora, todas elas são WUs Tinker ou WUs Gromacs normais.

Portugal não está parado

Para além de todos nós que diariamente dão o seu contributo para o avanço da Medicina e da Ciência através do projecto Folding@Home, equipas de pessoal especializado concentram esforços com o mesmo objectivo, embora de uma forma mais concisa.

Sendo o nosso principal objectivo ver mostras desses avanços, embora não tendo directamente haver com o Folding, notícias como estas merecem todo o nosso aplauso, ainda mais quando fica nos registos nacionais.

Caracterização de Cinases WNK, Uma Nova Subfamília de Proteína Cinases Expressa em Tumores do Cólon

Foi identificado e clonado por nós o gene de uma nova proteína cinase humana, localizada no cromossoma 12p13.3 e que codifica 2382 aminoácidos.

A sua principal característica consiste numa variação da sequência de um motivo conservado do domínio catalítico.

Esta variação foi também descrita na cinase do rato designada por WNK1 (with no K = lysine) e que corresponde a uma variante de silicone sem os exões 11 e 12.

O domínio catalítico da WNK1 tem maior homologia com as cinases humanas PAK2, MEKK3, e Raf-1. Foram ainda identificados outros três genes WNK humanos, que diferem em localização cromossomal e no padrão de expressão em tecidos mas apresentam alta homologia com o domínio catalítico da WNK1.

Estes genes foram classificados como WNK2, WNK3 e WNK4. Quando o domínio catalítico destas cinases foi comparado com as bases de dados, foram identificados a partir de vários organismos uns totais de 18 genes WNK relacionados.

O alinhamento das suas sequências revelou uma sequência assinatura das cinases WNK nos subdomínios I e II do domínio catalítico, o que sugere que estas proteínas constituem uma nova subfamília de proteínas cinase.

In INSA - Instituto Nacional de Saúde By Aquitério & Dazkarieh


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